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laboratoire LERFoB

COLIN Francis

photo identité Francis Colin
© UMR LERFoB
CR1 INRA, HDR - Equipe CPQB

• Contact

Francis Colin
LERFoB (Laboratoire d’Étude des Ressources Forêt-Bois)
UMR INRA-AgroParisTech 1092
Équipe Croissance, Production et Qualité des Bois
Centre INRA de Nancy
54280 CHAMPENOUX (France)
Tél: 03.83.39.40.42
francis.colin@inra.fr

• Education

Master 2 Biologie Forestière : Université Nancy I  1988
Ingénieur Forestier : Engref-Nancy  1990
Doctorat Sciences forestières : Engref-Nancy 1992
Habilitation à diriger des Recherches : Université Nancy I  2003

• Activités scientifiques 

►Thématiques
 
   ♦ Architecture de l’arbre

   ♦ Ramification : démographie et développement des fourches, branches séquentielles et épicormiques

   ♦ Formation du bois des branches et des nœuds

   ♦ Effet de l’environnement forestier et de ses perturbations (vent...) sur : la plasticité, l’acclimatation, les endommagements, les réparations

   ♦ Métabolites secondaires extraits des nœuds, de l’écorce, du bois

 ► Outils d'étude

   ♦ Tomographie à rayons X 

   ♦ Lidar terrestre

   ♦ Réseaux de placettes expérimentales 

   ♦ Modélisation statistique (modèle général et généralisé mixte,ajustement SUR)

►Direction de thèse

 - Van-Tho Nguyen (en cours). Estimation de la qualité extérieure par Lidar Terrestre. En collaboration avec T. Constant (LERFoB), A. Piboule (ONF RDI Nancy), A. Krähenbühl, B. Kerautret, I. Debled-Rennesson (LORIA)

- Jialin Song (en cours)Analyse QTL de la ramification du chêne pédonculé. En collaboration avec Antoine Kremer, Christophe Plomion, Catherine Bodénès (UMR BIOGECO Bordeaux) et Oliver Brendel (UMR EEF Nancy)

- Zineb Kebbi-Benkeder  2015 Biodiversité interspécifique et intraspécifique des extractibles nodaux. Thèse AgroParisTech en Sciences du bois et des fibres. 186p.  En collaboration avec P. Gérardin et S. Dumarçay (LERMAB)

- Jean-Baptiste Morisset, 2012. Tomographie à rayons X ; analyse et modélisation de l’ontogénèse des épicormiques du chêne sessile (Quercus petraea (L.) Matt.). Thèse AgroParisTech en Sciences Forestières. 142p  + annexes. En collaboration avec F. Mothe (LERFoB)

• Animation de la recherche

►Projets

        ►Européens

   ♦ 1997-1998 : FAIR-BM96.2554 Recommendations for afforestation of agricultural set-aside with oak species (Coordinateur)

   ♦ 1996-1999 : OAK-KEY (PL95-0823) New silvicultural alternatives in young oak high forests. Consequences on high quality timber production (Coordinateur)

   ♦ 1994-1998. Root-Arch  (CT93-1269) Aspects of sustainability by afforestation of agricultural set aside areas : development of roots and shoot/root ratios (Resp. INRA)

   ♦ 1992-1994. FOREST (CT91-0024) Silvicultural control and non-destructive assessment of timber quality in plantation grown spruces and Douglas fir (Resp. Tâche)

       ►Nationaux

   ♦ 2016. LABEX « Arbre » Projet « PROTEXTRA » (mesure du duramen des branches) (Responsable)

   ♦ 2016. LABEX « Arbre » Projet « Post-doc Zineb » (Post-doc à OSU Corvallis de Z. Kebbi-Benkeder ) (Responsable)

   ♦ 2015. LABEX « Arbre » Projet AFE « OAK-Epic » (Effet site sur la détermination des QTLs de ramification du chêne pédonculé) (Responsable)

   ♦ 2014. LABEX « Arbre » Projet AFE « Menzies0 »  (accueil de Nate Osborne de OSU Corvallis) (Responsable)

   ♦ 2012-2015. Contrat ONF-INRA ModelFor3 (Responsable d’actions) Actions « Génétique des épicormiques du chêne » et « Qualité du Sapin et du Douglas »

   ♦ 2012-2015. LABEX “Arbre”  Projet « Wood acclimation in disturbed environment » (« WADE »);  Responsable de tâche « Branch Wood »

   ♦ 2011. Contrat ONF-INRA ModelFor2. Responsable de thème 3 : « Croissance et qualité des bois » 

   ♦ 2005-2010. Contrat ONF-INRA ModelFor2. Responsable d’action A31 : « Élaboration de la qualité commerciale des grumes de Hêtre et de Chêne » 

   ♦ 2004-2005. Contrat ONF-INRA 4839B. Analyse des situations sylvicoles à risque de présence élevée de gourmands dans les peuplements de chêne sessile et pédonculé (Responsable)

► Organisation de colloques

   ♦ Conférence internationale « EPIC-CONF » Nancy (France) 14-17 Septembre 2017(organisateur)

   ♦ Groupe CAQSIS du département EFPA de l’INRA : « Croissance, amélioration et qualité des bois et modélisateurs travaillant sous la plateforme CAPSIS » (co-animateur)

   ♦ Conférence « MeMoWood » IUFRO group 5.01.04 « Wood Quality Modelling »  Nancy (France) 1-4 Octobre 2013 (organisateur)

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• Transfert – vulgarisation 

   ♦ Opérations sylvicoles pour améliorer la qualité des différents produits issus du bois

   ♦ Estimation des ressources forestières (bois d’œuvre, extractibles…) 

   ♦ Écologie et gestion forestières

   ♦ Formation continue : sylviculture et qualité des bois

  • Enseignement académique

(AgroParisTech Nancy & Master FAGE Université de Lorraine)

   ♦ Biologie du développement des arbres forestiers, urbains et fruitiers

   ♦ Dégâts de tempêtes en forêt

Publications

• Principales publications de rang A 

-Kebbi-Benkeder Z., Manso R., Dumarçay S., Gérardin P., Chopard B., Colin F., 2016b. Knot extractives: a model for analysing the eco-physiological factors that control the within and between-tree variability. Tree Physiology (soumis)

-Song J., Brendel O., Bodénès C., Plomion C., Kremer A., Colin F., 2016b. Genetic architecture of branching traits using X-ray computed tomography in oak. Tree Genetics and Genomes (accepté)

-Van-Tho Nguyen VT, Kerautret B,Debled-Rennesson I, Colin F, Piboule A, Constant T. Segmentation of defects on log surface from terrestrial Lidar data. 23rd International Conference on Pattern Recognition. Cancun, Mexique, Déc. 2016 

-Deroy A., Saiag F., Kebbi-Benkeder Z., Touahri N., Hecker A ., Morel-Rouhier M., Colin F., Dumarcay S., Gerardin P., Gelhaye E , 2015.  The GSTome Reflects the Chemical Environment of White-Rot Fungi. PLOS ONE 10 (10) Article Number: e0137083  

-Colin F., Laborie M-P., Fortin M., 2015b. Wood properties: future needs, measurements and modelling Annals of Forest Science, 72 (6) 665-670

-Kebbi-Benkeder, Z., Colin, F., Dumarçay, S., Gérardin, P., 2015a. Quantification and characterization of knotwood extractives. Annals of Forest Science, 77 (2), 277-284

-Bonnesoeur V., Fournier M., Bock J., Badeau V., Fortin M., Colin F., 2013. Improving statistical windthrow modeling of 2 Fagus sylvatica stand structures through mechanical analysis. For. Ecol. Manag. 289: 535-543

-Boukadida H., Longuetaud F., Colin F., Mothe F., Leban JM., 2012.  PithExtract: a robust algorithm for pith detection in computer tomography images of wood - application to 125 logs from 17 tree species.  Computers and Electronics 85: 90-98  

-Colin F., Ningre F., Fortin M., Huet S., 2012a. Quantification of Quercus petraea Liebl. forking based on a 23-year-long longitudinal survey For. Ecol. Manag. 282 : 133-141

-Colin F., Sanjines A., Fortin M., Bontemps JD., Nicolini E., 2012b. Fagus sylvatica trunk epicormics in relation to primary and secondary growth. An. Bot. 109: 365-377

-Courbet F., Herve JC., Klein E., Colin F., 2012. Diameter and death of whorl and interwhorl branches in Atlas cedar (Cedrus atlantica Manetti): a model accounting for acrotony An. For. Sci. 69: 125-138   

-Morisset JB., Mothe F.,  Bock J., Bréda N., Colin F.. 2012a. Epicormic ontogeny in Quercus petraea constrains the highly plausible control of epicormic sprouting by water and carbohydrates. An. Bot.  109: 365-377  

-Morisset JB., Mothe F., Chopard B., François D., Colin F., 2012b. Does past emergence of epicormic shoots control current composition of epicormic types? Ann. For. Sci. 69: 139-152

-Morisset JB., Mothe F., Colin F., 2012c. Observation of Quercus petraea epicormics with X-ray CT reveals strong pith-to-bark correlations: Silvicultural and ecological implications . For. Ecol. Manage. 278: 127-137   

-Colin F., Mechergui R., Dhote JF., Fontaine F., 2010a. Epicormic ontogeny on Quercus petraea trunks and thinning effects quantified with the epicormic composition An. For. Sci. 67: 813-822    

-Colin F., Ducousso A., Fontaine F., 2010b. Epicormics on 13-year-old Quercus petraea: low effect of provenance and high influence of branches and growth unit limits. Ann. For. Sci.  67: 312-323

-Colin F., Mothe F., Freyburger C., Morisset JB, Fontaine F., Leban JM., 2010c.  Tracking rameal traces in sessile oak trunks with X-ray computer tomography: biological bases, preliminary results and perspectives Trees 24: 953-967    

-Colin F., Robert N., Druelle JL., Fontaine F., 2008. Initial spacing has little influence on transient epicormic shoots in a 20-year-old oak plantation. Ann. For. Sci. 65 : 508-518

-Ningre F., Colin F., 2007. Frost damage on the terminal shoot as a risk of fork incidence on common beech (Fagus sylvatica L.). An. For. Sci. 64: 79-86

-Fontaine F., Mothe F., Colin F. et Duplat P., 2004.  Structural relationships between the epicormic formations on the trunk surface and the defects induced in the wood of Quercus petraea. Trees, 18: 295-306

-Drexhage M., et Colin F., 2003.  Effects of browsing on shoots and roots of naturally regenerated sessile oak seedlings. An. For. Sci.   60: 173-178   

-Drexhage M. et Colin F., 2001. Estimating root system biomass from breast-height diameters Forestry 74: 491-497  

-Farque L., Sinoquet H., Colin F., 2001. Canopy structure and light interception in Quercus petraea seedlings in relation to light regime and plant density Tree Physiol. 21: 1257-1267  

-Fontaine F., Colin F., Jarret P., Druelle JL., 2001. Evolution of the epicormic potential on 17-year-old Quercus petraea trees: first results  Ann. For. Res. 58: 583-592

-Drexhage M., Huber F., Colin F., 1999b. Comparison of radial increment and volume growth in stems and roots of Quercus petraea Plant and Soil 217: 101-110  

-Makinen H., Colin F., 1999.  Predicting the number, death, and self-pruning of branches in Scots pine. Can. J. For. Res  29: 1225-1236  

-Chaar H., Colin F., 1999. Impact of late frost on height growth in young sessile oak regenerations. Ann. For. Sci 56: 417-429  

-Vestol G., Colin F., Loubère L., 1999. Influence of progeny and initial stand density on the relationship between diameter at breast height and knot diameter of Picea abies. Scan. J. For. Res.  14: 470-480  

-Drexhage M., Chauvière M., Colin F., Nielsen CNN., 1999a. Development of structural root architecture and allometry of Quercus petraea Can J. For. Res.   29: 600-608  

-Fontaine F., Chaar H., Colin F., Clément C., Burrus M., Druelle JL., 1999. Preformation and neoformation of growth units on 3-year-old seedlings of Quercus petraea.  77: 1623-1631, 1999

-Danjon F.,  Sinoquet H., Godin C., Colin F., Drexhage M., 1999. Characterisation of structural tree root architecture using 3D digitising and AMAPmod software. Plant and Soil. 211: 241-258

-ChangSheng L., JianFeng S., YongFang X., Houllier F., Colin F., 1998.  Crown morphology of Norway spruce from usual tree measurements. Journal of Forestry Research (China) 9: 8-12 

-Mäkinen H. et F. Colin F., 1998.  Predicting branch angle and branch diameter of Scots pine from usual tree measurements and stand structural information. Can. J. For. Res. 28: 1686-1696 

-Meredieu C., Colin F., Herve JC., 1998. Modelling branchiness of Corsican Pine with mixed-effect models (Pinus nigra Arnold ssp. laricio (Poiret) Maire). An. Sci. For.  55: 359-374

-Chaar H., Colin F., Collet C., 1997a. Effects of environmental factors on the shoot development of Quercus petraea seedlings - A methodological approach Conference: Conference on Modelling Regeneration Success and Early Growth of Forest Stands Copenhagen Denmark June 10-13, 1996. For. Ecol. Manag. 97: 119-131

-Chaar H., Colin F., Leborgne G., 1997b. Artificial defoliation, decapitation of the terminal bud, and removal of the apical tip of the shoot in sessile oak seedlings and consequences on subsequent growth . Can. J. For. Res. 27: 1614-1621  

-Collet C., Colin F., Bernier F., 1997. Height growth, shoot elongation and branch development of young Quercus petraea grown under different levels of resource availability An. Sci. For. 54: 65-81

-Deleuze C., Herve JC., Colin F., Ribeyrolles L., 1996. Modelling crown shape of Picea abies: Spacing effects. Can. J. For. Res.  26 : 1957-1966 

-Houllier F., Leban JM., Colin F., 1995. Linking growth modelling to timber quality assessment for Norway spruce. For. Ecol. Manag. 74: 91-102

-Colin-Belgrand M., Colin F., Ranger J., 1993. Internal nutrient cycling in Chestnut wood (Castanea sativa Miller). A dynamic approach for a chronosequence of stands. 2. a model for the distribution of mineral nutrients. Acta oecologica_International J of Ecology  14: 747-769 

-Colin F., Houllier F., Joannes H., Haddaoui A. 1993. A model of the vertical distribution of diameters, angles and numbers of branches of three Picea abies provenances. Silvae Genetica  42: 206-222

-Colin F. et Houllier F., 1992. Branchiness of Norway spruce in Northeastern France. Predicting the main crown characteristics from usual tree measurements. 49: 511-538 

-Granier A., Huc R., Colin F., 1992. Transpiration and stomatal conductance of 2 rain-forest species growing in plantations (Simarouba amara and gloupia glabra) in French Guyana. An. Sci. For.  49: 17-24

-Colin F. et Houllier F., 1991. Branchiness of Norway spruce in North-eastern France – Modelling vertical trends in maximum nodal branch size. An. Sci. For. 48: 679-693

-Granier  A. et Colin F., 1990. Effects of soil drought on water relations in Abies bornmulleriana under natural conditions. An. Sci. For. 47: 189-200

-Granier  A., Bréda N., Claustres JP., Colin F., 1989. Variation of hydraulic conductance of some adult   conifers  under  natural conditions. Ann. Sci. For. 46 suppl., 357s-360s in Forest Tree Physiology. E Dreyer et al., eds    

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