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Encodage de l'architecture raméale (plug-in ImageJ)

Gourmands : un plug-in ImageJ pour l'encodage de l'architecture raméale à partir de piles d'images tomographiques

Ce plug-in permet de naviguer dans la pile d'images d'un billon pour décrire la forme et la trajectoire des noeuds, des traces de bourgeons et de la moelle (voir Colin et al. 2010, Longuetaud et al. 2012).
Le programme Bil3d permet de visualiser les résultats.
Installation :
Copier les fichiers gourmands_.jar et commons-math.jar dans le répertoire plugins d'ImageJ (en général "C:\ProgramFiles\ImageJ\plugins" pour windows, $HOME/.imagej/plugins sous Linux ou Mac OS X).
Pour lancer Bil3d sous windows, décompresser l'archive Bil3d_oin.zip et lancez l'executable Bil3d.exe. Sous linux ou Mac OS X, compiler le programme à partir de l'archive Bil3d_src.

Téléchargements :