En savoir plus

Notre utilisation de cookies

« Cookies » désigne un ensemble d’informations déposées dans le terminal de l’utilisateur lorsque celui-ci navigue sur un site web. Il s’agit d’un fichier contenant notamment un identifiant sous forme de numéro, le nom du serveur qui l’a déposé et éventuellement une date d’expiration. Grâce aux cookies, des informations sur votre visite, notamment votre langue de prédilection et d'autres paramètres, sont enregistrées sur le site web. Cela peut faciliter votre visite suivante sur ce site et renforcer l'utilité de ce dernier pour vous.

Afin d’améliorer votre expérience, nous utilisons des cookies pour conserver certaines informations de connexion et fournir une navigation sûre, collecter des statistiques en vue d’optimiser les fonctionnalités du site. Afin de voir précisément tous les cookies que nous utilisons, nous vous invitons à télécharger « Ghostery », une extension gratuite pour navigateurs permettant de les détecter et, dans certains cas, de les bloquer.

Ghostery est disponible gratuitement à cette adresse : https://www.ghostery.com/fr/products/

Vous pouvez également consulter le site de la CNIL afin d’apprendre à paramétrer votre navigateur pour contrôler les dépôts de cookies sur votre terminal.

S’agissant des cookies publicitaires déposés par des tiers, vous pouvez également vous connecter au site http://www.youronlinechoices.com/fr/controler-ses-cookies/, proposé par les professionnels de la publicité digitale regroupés au sein de l’association européenne EDAA (European Digital Advertising Alliance). Vous pourrez ainsi refuser ou accepter les cookies utilisés par les adhérents de l'EDAA.

Il est par ailleurs possible de s’opposer à certains cookies tiers directement auprès des éditeurs :

Catégorie de cookie

Moyens de désactivation

Cookies analytiques et de performance

Realytics
Google Analytics
Spoteffects
Optimizely

Cookies de ciblage ou publicitaires

DoubleClick
Mediarithmics

Les différents types de cookies pouvant être utilisés sur nos sites internet sont les suivants :

Cookies obligatoires

Cookies fonctionnels

Cookies sociaux et publicitaires

Ces cookies sont nécessaires au bon fonctionnement du site, ils ne peuvent pas être désactivés. Ils nous sont utiles pour vous fournir une connexion sécuritaire et assurer la disponibilité a minima de notre site internet.

Ces cookies nous permettent d’analyser l’utilisation du site afin de pouvoir en mesurer et en améliorer la performance. Ils nous permettent par exemple de conserver vos informations de connexion et d’afficher de façon plus cohérente les différents modules de notre site.

Ces cookies sont utilisés par des agences de publicité (par exemple Google) et par des réseaux sociaux (par exemple LinkedIn et Facebook) et autorisent notamment le partage des pages sur les réseaux sociaux, la publication de commentaires, la diffusion (sur notre site ou non) de publicités adaptées à vos centres d’intérêt.

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit des cookies sessions CAS et PHP et du cookie New Relic pour le monitoring (IP, délais de réponse).

Ces cookies sont supprimés à la fin de la session (déconnexion ou fermeture du navigateur)

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit du cookie XiTi pour la mesure d’audience. La société AT Internet est notre sous-traitant et conserve les informations (IP, date et heure de connexion, durée de connexion, pages consultées) 6 mois.

Sur nos CMS EZPublish, il n’y a pas de cookie de ce type.

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de l’INRA par email à cil-dpo@inra.fr ou par courrier à :

INRA
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

Menu Logo Principal Université de Reims Champagne-Ardenne Fractionnement des AgroRessources et Environnement

Fractionnement des AgroRessources et Environnement INRA / URCA

Fractionnement des Agroressources et Environnement

Unité Mixte de Recherche Inra/URCA

PAËS Gabriel

Directeur de Recherche
Gabriel __

Adresse : UMR FARE, 2 esplanade Roland-Garros, BP 224, 51686 Reims, France
Téléphone : +33 (0)3 26 77 36 25
Fax : +33 (0)3 26 77 35 99
Mél. : gabriel.paes@inra.fr

Twitter

@DrGabrielPaes

Google Scholar

Research Gate

Recherches actuelles

Page web GP

Mon projet de recherche vise à développer des approches nouvelles pour permettre une meilleure compréhension de l'architecture des parois végétales (parois secondaires), avec l’objectif de modéliser les parois en 3D, et de mettre en évidence puis de hiérarchiser les sites de blocages à leur déstructuration contrôlée. La stratégie consiste à analyser la mobilité et les interactions de sondes fluorescentes de types chimiques ou biologiques (anticorps, enzymes ou CBM) dans des systèmes modèles contrôlés et des systèmes de parois natifs et pré-traités, par des techniques de microscopie confocale (FRAP, FRET) et d'imagerie 4D. L'ensemble des données obtenu est ensuite corrélé aux propriétés chimiques, physiques et spectrales des systèmes lignocellulosiques et à leur propension à être saccharifiés. Cette stratégie appliquée à des échantillons de biomasse végétale permet de mettre en évidence les paramètres limitant la saccharification.

Mots-clés

Bioraffinerie, biomasse lignocellulosique, enzyme, accessibilité, interaction, microscopie, fluorescence, 4D, modélisation

Projets

Financement par l'ANR : porteur du projet Lignoprog (2015-2018) et responsable d'une tâche du projet Funlock (2014-2017)

Financement par l'INRA : porteur du projet Mobiprot (2013-2014) et participant aux projets Enzydam (2011-2012), Apsali (2013-2014), FluoFlax4D (2018-2019)

Autres : participation au projet Futurol, plusieurs projets au synchrotron SOLEIL

Carrière

Depuis 2017 - Directeur de Recherche (DR2), UMR FARE (Reims)

2014-2017 - Chargé de Recherche (CR1), UMR FARE

2009-2014 - Chargé de Recherche (CR2), UMR FARE

2007-2009 - Cadre de Recherche, METabolic EXplorer, Clermont-Ferrand - Développement de dosages enzymatiques et de protocoles de purification et de caractérisation d’enzymes dans le cadre de projets d’ingénierie métabolique pour l’obtention de composés chimiques par fermentation industrielle

2006-2007 - Chercheur post-doctorant, Universités de Marseille / INRA (UMR 1163 BCF) - Intégration de gènes codant pour de nouvelles cellulases et hémicellulases dans le génome de Trichoderma reesei

2005-2006 - Chercheur post-doctorant, Université de Nantes / CNRS (UMR 6204 U3B) et Université de Reims / INRA (UMR 614 FARE) - Relations structure/fonction du mouvement de boucles d’hémicellulases et d’accessibilité de substrats par le couplage modélisation/robotique moléculaire

Formation

2016 - Habilitation à Diriger des Recherches, Université de Reims Champagne-Ardenne - Explorons la Biomasse Lignocellulosique !

2001-2005 - Doctorat en Biochimie et Biologie Moléculaire, Université de Reims Champagne-Ardenne / INRA (UMR FARE) - Étude structure/fonction d’hémicellulases thermostables : la xylanase GH−11 et l’arabinofuranosidase GH−51 de Thermobacillus xylanilyticus

2004 - Boursier Marie-Curie (durant mon doctorat), The Danish University of Pharmaceutical Sciences, Copenhague (Danemark) - Cristallisation et cristallographie aux rayons X d’hémicellulases

2001 - Master de Physicochimie et qualité des bio-produits, Faculté des Sciences, Université de Nantes - Accessibilité de substrats glycosidiques à différentes glycosyl-hydrolases et glycosyl-transférases par modélisation moléculaire

2000 - Maîtrise de Chimie-biologie, IUP de Chimie-Biologie de Nantes - Analyse topographique d’α-amylases et arrimage de substrats amylacés par modélisation moléculaire

Domaines de compétences

Conception et caractérisation d'assemblages lignocellulosiques bio-inspirés et de parois végétales d'origine variée et pré-traitées
Conception et caractérisation de sondes fluorescentes
Utilisation de la microscopie confocale de fluorescence pour caractériser l'architecture (FLIM), la mobilité (FRAP) et les interactions (FRET) des sondes
Imagerie 3D & 4D
Biologie moléculaire des procaryotes et microbiologie des procaryotes/eucaryotes
Purification et caractérisation biochimique/enzymatique/biophysique de protéines recombinantes
Cristallogenèse, modélisation/dynamique/robotique moléculaires de protéines

Production scientifique

31 articles à comité de lecture, plus de 45 communications orales et posters dans des congrès nationaux et internationaux et 3 chapitres d'ouvrages.

Sélection d'articles :

Herbaut M, Zoghlami A, Habrant A, Falourd X, Foucat L, Chabbert B, Paës G (2018) Multimodal analysis of pretreated biomass species highlights generic markers of lignocellulose recalcitrance. Biotech. Biofuels 11, 52. Open Access

Terryn C, Paës G, Spriet C (2018) FRET-SLiM on native autofluorescence: a fast and reliable method to study interactions between fluorescent probes and lignin in plant cell wall. Plant Methods 14, 74. Open Access

Chabbert B, Habrant A, Herbaut M, Foulon L, Aguié-Béghin V, Garajova S, Grisel S, Bennati-Granier C, Gimbert-Herpoel I, Jamme F, Refregiers M, Sandt C, Berrin JG, Paës G (2017) Action of lytic polysaccharide monooxygenase on plant tissue is governed by cellular type. Scientific Reports 7, 17792. Open Access

Auxenfans T, Terryn C, Paës G (2017) Seeing biomass recalcitrance through fluorescence. Scientific Reports 2017, 7, 8838. Open access

Auxenfans T, Crônier D, Chabbert B, Paës G (2017) Understanding the structural and chemical changes of plant biomass following steam explosion pretreatment. Biotechnology for Biofuels, 10: 36. Open Access

Paës G, Habrant A, Ossemond J, Chabbert B (2017) Exploring accessibility of pretreated poplar cell walls by measuring dynamics of fluorescent probes. Biotechnology for Biofuels 10: 15 Open Access

Fong M, Berrin JG, Paës G (2016) Investigation of the binding properties of a multi-modular GH45 cellulase using bioinspired model assemblies. Biotechnology for Biofuels 9: 12 Open access

Paës G (2014) Fluorescent probes for exploring plant cell wall deconstruction: a review. Molecules 19: 9380-9402 Open access

Paës G, Burr S, Saab MB, Molinari M, Aguié-Béghin V and Chabbert B (2013) Modeling progression of fluorescent probes in bioinspired lignocellulosic assemblies. Biomacromolecules 14: 2196–2205 DOI

Paës G, Berrin JG, Beaugrand J (2012) GH11 xylanases: structure/function/properties relationships and applications. Biotechnol. Adv. 30: 564-592 DOI

Encadrement de doctorants

Amandine LEROY (2017-2020). Approche multi-échelle du suivi dynamique de la déconstruction de la biomasse lignocellulosique. Directeur de thèse, co-directrice : Fabienne Guillon (INRA)

Aya ZOGHLAMI (2016-2019). Techniques avancées de microscopie pour l’imagerie 4D de la déconstruction de la biomasse lignocellulosique. Directeur de thèse, co-encadrante : Christine Terryn (Université de Reims Champagne-Ardenne)

Eléonore LAMBERT (2015-2018). Apports de la Microscopie à Force Atomique à l’étude de phénomènes dynamiques en biologie et développement instrumental associé. Directeur de thèse : Michaël Molinari (Université de Reims Champagne-Ardenne). Encadrement sur un chapitre de thèse. Thèse soutenue le 20 décembre 2018

Mickaël HERBAUT (2014-2017). Déconstruction de la biomasse lignocellulosique : corrélation entre la progression et l’activité enzymatiques. Directeur de thèse. Thèse soutenue le 13 octobre 2017 (5 publications)

Responsabilités collectives

FARE : responsable de la Cellule Communication (depuis 2012), membre de la Cellule Informatique (depuis 2010)

Département CEPIA de l'INRA : coordinateur du Défi "Conception raisonnée de la qualité des aliments et des bioproduits" (depuis 2017), animateur de l'Action "Caractériser des matières aux différentes échelles et aux différents stades de transformation" (depuis 2017), membre élu du Conseil Scientifique (depuis 2016), membre élu de la Commission Scientifique Spécialisée SIAMM (depuis 2016), membre du groupe Communication (depuis 2013).

National : membre du bureau du Réseau Français des Parois (RFP) (depuis 2014), élu CFDT (2011-2014, 2015-2017) de la Commission Administrative Paritaire Nationale des Chargés de Recherche à l'INRA.

International : coordinateur du congrès "Exploring Lignocellulosic Biomass!" (ELB) organisé à Reims en 2016 et 2018.